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gcc-4.0から、

warning: pointer targets in assignment differ in signedness

といった類のwarningがたくさん出ると思います。

これは、ポインタ型の代入などにおいて、
その指し示す値の型の符号が違う場合に出てきます。

要は、

unsigned char *a;
char *b;
...
a = b

なんてやると警告されます。

地道に直し中。